Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms