Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg9aQ68FE2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms