Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BcanQ61361 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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