Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms