Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp48Q3V0C5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp48Q3V0C5 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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