Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms