Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms