Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Traf3ip1Q149C2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Traf3ip1Q149C2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms