Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rundc1Q0VDN7 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms