Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms