Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GscQ02591 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
GscQ02591 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms