Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms