Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rps29P62274 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms