Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atp5bP56480 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atp5bP56480 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atp5bP56480 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atp5bP56480 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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