Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp1P55194 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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