Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Srp9P49962 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms