Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Grik2P39087 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Grik2P39087 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Grik2P39087 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Grik2P39087 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Grik2P39087 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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