Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NapbP28663 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NapbP28663 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NapbP28663 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NapbP28663 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NapbP28663 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NapbP28663 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NapbP28663 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NapbP28663 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms