Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
P18530 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
P18530 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
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P18530 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
P18530 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
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P18530 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
P18530 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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