Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Hoxb4P10284 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms