Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tgfb1P04202 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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