Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ccl20O89093 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl20O89093 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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