Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Ssxb8B1AY40 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ssxb8B1AY40 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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