Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Tlr5Q9JLF7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tlr5Q9JLF7 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms