Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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