Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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