Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Derl3Q9D8K3 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms