Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms