Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rdm1Q9CQK3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdm1Q9CQK3 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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