Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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