Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
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Dnajc28Q8VCE1 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Dnajc28Q8VCE1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Dnajc28Q8VCE1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Dnajc28Q8VCE1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Dnajc28Q8VCE1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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