Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms