Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ubash3bQ8BGG7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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