Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc50Q810U5 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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