Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pnma8aQ80VM8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms