Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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