Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms