Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Krt42Q6IFX2 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms