Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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BcanQ61361 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
BcanQ61361 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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BcanQ61361 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BcanQ61361 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms