Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Syne3Q4FZC9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms