Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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