Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Perm1Q149B8 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms