Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rundc1Q0VDN7 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms