Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms