Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Siah1bQ06985 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms