Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Emx2Q04744 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms