Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Hoxd13P70217 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd13P70217 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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