Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms