Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rps29P62274 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rps29P62274 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms