Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CartptP56388 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CartptP56388 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CartptP56388 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms